29 июля 1954 г. Синод заслушал его прошение, начинавшееся словами: «Происшедшее 10 апреля с. г. нападение на меня настолько повлияло на мое моральное состояние, что дальнейшее пребывание в г. Калинине для меня стало невозможным», и уволил архиепископа на покой «с производством установленной для епископов пенсии» .
Судебный процесс над участниками ограбления архиерейского дома в Калинине показал, что организатором оказался секретарь епархиального управления. Вскрывшиеся на суде скандальные подробности жизни архиепископа Алексия (Сергеева), включая предоставление Патриархии заведомо ложных сведений, оперативно растиражировали многие областные газеты.
Синод вернулся к рассмотрению дела архиепископа Алексия 12 ноября 1954 г.:
«Имели суждение о деле архиепископа Алексия, бывшего Калининского. Принимая во внимание имеющиеся в Патриархии данные о характере управления б[ывшим] Калининским архиепископом Алексием последовательно вверяемых им епархий, а также и личной жизни его, производившей на всех местах его служения крайний соблазн как в среде духовенства, так и верующих, жизни и действий, не согласных с носимым им священным саном и получивших широкую огласку, Священный Синод, скорбя о допущенном архиепископом Алексием посрамлении священного сана, постановляет: состоящего ныне за штатом бывшего Калининского архиепископа Алексия лишить и на будущее время права занимать какую-либо епископскую кафедру, а также настоятельские должности в монастырях и приходах, а также получать установленную для пребывающих на покое архиереев пенсию. Вместе с тем Священный Синод считает нужным опровергнуть неверное сообщение некоторых газет о том, что Патриархией была произведена в свое время ревизия управления Калининской епархией и что ревизоры якобы покрыли все замеченные ими недостатки, будучи подкуплены».
14 марта 1957 г. архиепископ Алексий все равно получил назначение на Алма-атинскую кафедру, но и оттуда скоро был смещен.
Митрополит Крутицкий и Коломенский Ювеналий (Поярков) поведал о том, как архиепископ искал поддержку в своих притязаниях у заведующего канцелярией Патриархии архимандрита Никодима (Ротова), будущего митрополита Ленинградского. Состоявшаяся между ними беседа не оставила у просителя никаких надежд: архимандрит Никодим оказался тем мальчиком, которому архиепископ Алексий при своих служениях в Рязани в 1942–1944 гг. запрещал прислуживать и удалял из алтаря, опасаясь неудовольствия властей.
https://www.sedmitza.ru/text/413984.html